Output data Comparison of GeneMark.hmm

with GeneBank annotation and GeneScan data output
A. thaliana DNA sequence: AC002337


page 2: Summary

Denotes GeneBank annotation
Denotes result congruent to GeneBank
Denotes result opposing GeneBank and at least one other program
Denotes result which matches all other programs but does not match GeneBank annotation
                           
GeneBank   GeneMark.hmm   GenScan   FGenesH
                + 72 129   I+ 163 185
I+ 2354 2523   + 2354 2523   + 2354 2523   + 2354 2523
+ 3624 3852   + 3624 3852   + 3624 3852   + 3624 3852
+ 4550 4637   + 4550 4637   + 4550 4637        
+ 4987 5053   + 4987 5053   + 4987 5053   + 4802 5053
+ 5220 5336   + 5220 5336   + 5220 5336   + 5220 5336
+ 6458 6624   + 6458 6624   + 6458 6624   + 6458 6624
+ 7401 7495   + 7401 7495   + 7401 7495   + 7401 7495
+ 8580 8709   + 8580 8709   + 8580 8709   + 8580 8709
+ 8804 8886   + 8804 8886   + 8804 8886   + 8804 8886
+ 9055 9134   + 9055 9134   + 9055 9134   + 9055 9134
+ 9315 9405   + 9315 9405   + 9315 9405   + 9315 9405
T+ 9956 10138   T+ 9956 10138   T+ 9956 10138   + 9956 10134
I+ 11207 11272   I+ 11207 11272   I+ 11207 11272   + 10352 10402
+ 11624 11701   + 11624 11701   + 11624 11701   + 11867 11987
+ 12699 12821   + 12765 12830   + 12765 12821   + 12699 12821
+ 12908 13028   + 12908 13028   + 12908 13028   + 12908 13028
+ 14412 14540   + 14454 14540   + 14454 14540   + 14412 14540
+ 15709 15868   + 15709 15868   + 15709 15868   + 15709 15868
+ 15980 16081   + 15980 16081   + 15980 16081   + 15980 16081
+ 16574 16691   + 16574 16691   + 16574 16709   + 16574 16691
T+ 16947 17093   T+ 16947 17093   + 16947 17030   T+ 16947 17093
                + 18205 18275        
I+ 18491 18715   I+ 18491 18715   + 18532 18715   I+ 18491 18715
                + 18833 18850        
+ 18913 18969   + 18913 18969   + 18913 19077   + 18913 18969
+ 19174 19284   + 19174 19284   + 19174 19284   + 19174 19284
+ 19390 19509   + 19390 19509   + 19390 19509   + 19390 19509
+ 19636 19743   + 19636 19743   + 19636 19743   + 19636 19743
+ 21463 21638   + 21463 21638   + 21466 21638   + 21463 21638
+ 21770 21869   + 21770 21869   + 21770 21869   + 21770 21869
+ 22207 22276   + 22207 22276   + 22207 22276   + 22207 22276
+ 22550 23095   + 22550 23095   + 22550 23095   + 22550 23095
+ 24910 24978   + 24910 24978   + 24910 24978   + 24910 24978
+ 25080 25333   + 25080 25146   + 25080 25333   + 25080 25333
        + 25280 25333                
T+ 25428 25601   T+ 25428 25494   T+ 25428 25601   T+ 25428 25601
        S- 28316 28768   S- 28316 28768        
                        T- 29434 29520
                        - 29645 29896
                        I- 31227 31265
I+ 32273 32299                   I+ 32273 32299
+ 32668 32755   I+ 32701 32755   I+ 32701 32755   + 32668 32755
+ 33308 33499   + 33308 33499   + 33308 33499   + 33308 33499
+ 33623 33769   + 33623 33769   + 33623 33769   + 33623 33769
+ 34735 34868   + 34735 34868   + 34735 34868   + 34735 34868
+ 35079 35251   + 35079 35251   + 35079 35251   + 35079 35251
+ 35806 36043   + 35806 36043   + 35806 36043   + 35806 36043
+ 36915 37139   + 36915 37139   + 36915 37139   + 36915 37139
+ 37540 37703   + 37540 37703   + 37540 37703   T+ 37540 37707
+ 38073 38189   + 38073 38189   + 38073 38189        
T+ 38284 38389   T+ 38284 38389   T+ 38284 38389        
        T- 39059 39273   T- 39059 39273   T- 39059 39273
        - 39366 39520   - 39366 39520   - 39366 39520
        - 39987 40063   - 39987 40063   - 39987 40063
        - 40190 40372   - 40190 40372   - 40190 40372
        - 40538 40630   - 40538 40630   I- 40538 40573
        I- 41551 41613                
                I- 46878 46880   I+ 45796 45818
        I+ 53493 53580                
                I+ 54922 54980        
                + 55319 55404   + 55319 55404
        + 55995 56128   + 55995 56128   + 55995 56128
        + 56339 56511   + 56339 56511   + 56339 56511
        + 56747 56984   + 56747 56984   + 56747 56984
        + 57581 57805   + 57581 57805   + 57581 57805
        + 58118 58314   + 58118 58314   T+ 57969 58004
        + 58685 58801   + 58685 58801        
        T+ 58896 59001   T+ 58896 59001        
T- 59671 59885   T- 59671 59885   T- 59671 59885   T- 59671 59885
- 59978 60132   - 59978 60132   - 59978 60132   - 59978 60132
- 60598 60674   - 60598 60674   - 60598 60674   - 60598 60674
- 60801 60983   - 60801 60983   - 60801 60983   - 60801 60983
- 61149 61241   - 61149 61241   - 61149 61241   - 61149 61241
                        - 61822 61875
- 62741 62820   - 62741 62820           - 62741 62820
- 62953 63022   - 62923 63022   - 62933 63022   - 62953 63022
I- 64036 64116   I- 64036 64116   I- 64036 64563   I- 64036 64116
I+ 65492 65570   I+ 65492 65570   I+ 65492 65570   I+ 65492 65570
+ 66961 67167   + 66961 67167   + 66961 67167   + 66961 67167
+ 68050 68306   + 68050 68306   + 68050 68306   + 68050 68306
+ 68409 68511   + 68409 68511   + 68409 68511   + 68409 68511
+ 69827 69853   + 69827 69853   + 69827 69853   + 69827 69853
+ 70061 70143   + 70061 70143   + 70061 70149   + 70061 70143
+ 70229 70280   + 70229 70280   + 70229 70280   + 70229 70280
+ 70404 70552   + 70404 70552   + 70404 70552   + 70404 70552
+ 70963 71103   + 70963 71103   + 70963 71103   + 70963 71103
+ 71330 71407   + 71330 71407   + 71330 71407   + 71330 71407
+ 71795 71947                   + 71795 71947
+ 72161 72271   + 72161 72271   + 72161 72271   + 72161 72271
+ 72361 72468   + 72361 72468   + 72361 72468   + 72361 72468
+ 72754 72913   + 72754 72913   + 72754 72913   + 72754 72913
+ 73251 73369   + 73251 73382   + 73251 73369   + 73251 73382
+ 73508 73560   + 73512 73560   + 73508 73560   + 73512 73560
+ 74757 74950   + 74757 74950   + 74757 74950   + 74757 74950
T+ 75138 75270   + 75138 75223   + 75138 75223   + 75138 75202



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Atlanta, GA 30324


PH: +1 (404) 579 - 2975

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