Output data Comparison of GeneMark.hmm

with GeneBank annotation, GeneScan and FGenesH output data
Human DNA sequence: HUMBRCA1


page 2: Summary

Denotes GeneBank annotation
Denotes result congruent to GeneBank
Denotes result opposing GeneBank and at least one other program
Denotes result which matches all other programs but does not match GeneBank annotation
                             
GeneBank   GeneMark   GeneScan   FGenesH
                I+ 305 415   I+ 305 415
        - 2063 2145                
        - 2284 2348                
I+ 4639 4718                        
        I- 6179 6260                
+ 12955 13008                        
        I+ 19194 19271                
+ 22201 22278   + 22201 22256                
+ 23778 23866                        
+ 24473 24612                        
+ 28853 28958           + 28856 28958   + 28856 28958
+ 31443 31488                        
+ 32810 32886   + 32810 32886                
+ 33872 37297   + 33872 37342   + 33872 37020   + 33872 37020
                + 37099 37297        
+ 37700 37788   + 37700 37788   + 37700 37788        
+ 46156 46327   + 46156 46327   + 46159 46327        
+ 52118 52244   + 52118 52244   + 52118 52244   + 52135 52244
+ 54211 54401   + 54211 54401   + 54211 54401   + 54211 54401
+ 57494 57804   + 57494 57804   + 57494 57804   + 57494 57804
+ 61038 61125           + 61038 61125        
+ 64782 64859                        
+ 71598 71681   + 71598 71681   + 71598 71681   + 71598 71681
+ 77620 77674   + 77620 77674   + 77620 77674   + 77620 77674
+ 79543 79616           + 79543 79616        
+ 81034 81094           + 81034 81094        
T+ 82936 83060   T+ 82936 83060   T+ 82936 83060   T+ 82936 83060
S- 48899 49390                        
        I+ 92325 92398                
        + 93804 93897                
                T- 93977 94051        
        T+ 95058 95249                
T- 100054 100302   T- 100054 100302   - 100058 100302   T- 100054 100302
- 100539 100673   - 100539 100673   - 100539 100673   - 100539 100673
- 101442 101551   - 101442 101551   - 101442 101551   - 101442 101551
- 102687 102774   - 102687 102774   - 102687 102774   - 102687 102774
I- 103285 103386   I- 103285 103386   I- 103285 103386   - 103285 103623
I+ 106682 106789   I+ 106403 106789   I+ 106403 106789   I- 103994 104029
                        I- 106403 106789
+ 109927 110134   + 109927 110134   + 109927 110134   + 109927 110134
+ 110520 110690   + 110520 110690   + 110520 110690   + 110520 110690
+ 110796 110885   + 110796 110885   + 110796 110885   + 110796 110885
+ 112774 113015   + 112774 113021   + 112774 113021   + 112774 113021
T+ 113178 113261   T+ 113178 113261   T+ 113178 113261   T+ 113178 113261
T- 115033 115214   T- 115023 115214   T- 115023 115214   T- 115023 115214
- 115440 115546   - 115440 115546   - 115440 115546   - 115440 115546
- 115660 115846   - 115660 115846   - 115660 115846   - 115660 115846
- 115949 116055   - 115949 116055   - 115943 116055   - 115949 116055
I- 116128 116275   - 116128 116275   - 116128 116275   - 116128 116275

Gene Probe, Inc.
1106 Wrights Mill Court
Atlanta, GA 30324


PH: +1 (404) 579 - 2975

Technical Support
Licensing Support